Ante todo mucha calma.
La principal diferencia es el reclutamiento de fibras musculares: en la fase negativa del movimiento, intervienen hasta un 30% más de fibras si controlamos el peso durante la bajada porque eliminamos el factor de la inercia. Implicamos las fibras rojas, las de contracción lenta.
Entiendo que estamos hablando de hipertrofia, y por lo tanto no usamos pesos máximos, con los cuales hacer esto es imposible. En entrenos de fuerza máxima lo que se procura es levantar el máximo peso posible y por eso necesitamos imprimir la máxima velocidad de la que somos capaces, implicando las fibras blancas o de contracción rápida.
Mi recomendación en las rutinas de hipertrofia es controlar mucho la velocidad de ejecución por lo menos en los auxiliares, que suelen ser ejercicios de una sola articulación y por lo tanto bastante menos exigentes, por lo que podemos fijarnos más en este tipo de aspectos. En los compuestos con usar pesos considerables (aunque no máximos) ya es suficiente.