En este artículo lo explican más o menos bien:
Candidatos entre rejas
Vamos, que mientras estás en prisión provisional y no haya sentencia firme no pierdes derechos políticos así que sí, pueden presentarse y salir electos. Puchi no está en prisión provisional pero no hay sentencia firme en su contra así que imagino que se le aplica lo mismo.
En cuanto a lo del acta, creo que es algo que tiene que hacerse en persona, indelegable. Es más, ese mismo artículo que pego cita a un etarra que (imagino que estando en prisión provisional, no condenado de manera firme porque en tal caso estaría inhabilitado) fue a Rentería a recoger su acta de concejal y luego de vuelta al meco. Así que sería como tú dices, si sale elegido y no ha vuelto a España, ha de hacerlo si quiere ocupar el cargo. Salvo que se saquen el enésimo truco de la chistera y pretenda hacerlo mediante un poder o alguna cosa así, que creo que no es posible pero no pongo la mano al 100% en el fuego.
Bueno, pero puede suceder que Bélgica deniegue la extradición y Puchi sea elegido como miembro del Parlament, en cuyo caso podría ocurrir lo que plantea Edelweiss, que para tomar posesión del cargo o viene (y lo trincan) o se queda sin ser parlamentario.